Trong hóa học, selen trioxit có tính chất tương tự như lưu huỳnh trioxit, hơn là telua trioxit:[3]

Tại 120 °C selen trioxit phản ứng với selen dioxide để tạo thành hợp chất diselen pentaoxit Se (VI) -Se (IV):[4]

Nó phản ứng với selen tetrafluoride để hình thành selenoyl fluoride, selen fluoride tương tự của lưu huỳnh fluoride:

Với lithi oxit và natri oxit nó phản ứng tạo thành các muối SeVIO6−
6 và SeVIO66−:[5] Với Li2O, nó cho Li4SeO5, chứa anion pyramid bậc ba SeVIO54− với các liên kết xích đạo, 170.6-171.9 pm và dài hơn lên kết Se-O là 179,5. Với Na2O nó cho Na4SeO5, chứa hình vuông SeVIO54−, với độ dài liên kết Se-O từ khoảng 1.729 → 1.815 pm và Na12(SeO4)3(SeO6), chứa các hình tam giác SeVIO66−. SeVIO66− là base liên hợp của axit orthoselenic (Se(OH)6).